Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Zfp988F6VKC7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp988F6VKC7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms