Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms