Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms