Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm5478D3Z6R0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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