Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cttnbp2B9EJA2 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms