Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce3B5KM66 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms