Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms