Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prrt4B2RU40 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms