Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Gm2012B1B0R1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2012B1B0R1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2012B1B0R1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2012B1B0R1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2012B1B0R1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2012B1B0R1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2012B1B0R1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2012B1B0R1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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