Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NhsB1AV60 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NhsB1AV60 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms