Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gbp4A4UUI3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms