Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Prdm16A2A935 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm16A2A935 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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