Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Cldn8Q9Z260 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms