Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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