Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop7Q9DCH2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms