Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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