Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim23Q9DAL0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms