Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms