Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms