Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprtQ99M80 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms