Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hps4Q99KG7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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