Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Smim11aQ99J19 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim11aQ99J19 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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