Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trim59Q922Y2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim59Q922Y2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms