Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Srsf4Q8VE97 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms