Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubxn4Q8VCH8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms