Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Klf17Q8CFA7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms