Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Znf428Q8C1M2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms