Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Lrrtm2Q8BGA3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Lrrtm2Q8BGA3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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