Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChfrQ810L3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms