Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pnma8aQ80VM8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms