Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms