Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nop58Q6DFW4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms