Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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