Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms