Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp7Q60973 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms