Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Csnk2a1Q60737 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csnk2a1Q60737 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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