Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3aQ60520 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3aQ60520 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms