Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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