Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms