Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rnf166Q3U9F6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms