Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms