Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnf149Q3U2C5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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