Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms