Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ttc39dQ0VF76 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms