Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxd1Q01822 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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