Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Col8a1Q00780 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms