Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Arf1P84078 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms