Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smad1P70340 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms