Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrig1P70193 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms