Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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